Судебные органы в Новосибирске начинают отсчет своей истории от назначенного в 1900 году в п. Ново-Николаевский мирового судьи 5 участка Томского уезда.

28 июля 1920 года избранной на Ново-Николаевском уездном совещании Народных судей Комиссией по распределению участков были учреждены несколько новых участков, изменена их нумерация, по результатам работы которой в Ново-Николаевске были учреждены участки Народных Судей, где первый был участок Центрального района г. Ново-Николаевска.

В 1929 году был образован Новосибирский район, включавший на тот момент г. Новосибирск, в составе Новосибирского округа Сибирского края, с 1930 года в составе Западно-Сибирского края. В 1937 году район был включен во вновь образованную Новосибирскую область. В 1939 году из состава района был выведен г. Новосибирск, образовавший самостоятельное административно-территориальное образование.

13 октября 1933 года постановлением Президиума Новосибирского Городского Совета РК и КД был организован народный суд Новосибирского района, обслуживающий сельские местности в составе одного судьи. В середине 40-х годов народный суд Новосибирского района стал состоять из двух судебных участков, размещенных на Вокзальной Магистрали.

В последствии суд, как и район, закономерно лишившись приставки «сельский», долгое время размещался в здании, являющимся памятником архитектуры Новосибирска по адресу Красный проспект, 12. В 1940-1950 годах здесь был Новосибирский областной суд, затем больница МВД.

С 2001 по 2022 года Новосибирский районный суд Новосибирской области располагался в здании по улице Бетонная дом 39. С 05 декабря 2022 года суд располагается в просторном здании по улице Титова дом 184, по настоящее время.

В разные годы в суде работали известные многим в настоящее время судьи, Владимир Павлович Литвинский, Галина Ивановна Колесник, Виктория Борисовна Быкова, Светлана Николаевна Ким, Наталья Анатольевна Кощеева, назначенные по результатам своей добросовестной работы в районном суде судьями Новосибирского областного суда. Рыбакаова Татьяна Григорьевна является судьей Новосибирского областного суда до настоящего времени. Литвинский Владимир Павлович в период с 1994 по 2004 годы возглавлял Новосибирский областной суд.

Новосибирский районный суд Новосибирской области возглавляли Николай Тимофеевич Гуров, Валентина Владимировна Шумская, Суслова Наталья Георгиевна, Зверинская Анастасия Константиновна.

Сейчас в штате суда находится 15 судей, 44 штатных единицы – аппарат суда.